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九尾之乱

影复原职

尽管四代火影成功击退了九尾，但为此付出的牺牲实在太大，紧接着木叶高层与村中的忍者们一起讨论着选择合适的火影继承人，奈良鹿久提出由水门的后一代忍者继位，但转寝小春认为他们的经验还不足以领导众人，此时猿飞日斩挺身而出，自愿担此重任，随后得到了木叶高层水户门炎、转寝小春等众人的支持。[3]

再度继位火影

猿飞日斩是忍界史上实际执掌火之国最高权力时间最长的火影，也是最长寿的火影。

于心不忍

不久后，村里从下忍到中忍甚至连暗部的上忍都陆续下落不明，日斩收到了大蛇丸形迹可疑的情报，于是带领着暗部精英成员前往禁术基地围攻大蛇丸，日斩本想杀他，但最后于心不忍，于是让大蛇丸逃走了。

研究禁术的大蛇丸

挽救行动

若干年后，此时的日斩已进入老年时期，宇智波一族因对村子的不满而决定在木叶发动政变，日斩与团藏等木叶高层意识到，不能让宇智波发动政变。日斩与团藏等木叶高层利用面具男宇智波带土、宇智波止水、宇智波鼬做好应对准备与解决手段。

宇智波政变

随后引发了一场宇智波家族灭门的悲剧，紧接着日斩与团藏两人招来了大量暗部与根的精英成员，分别去往宇智波地区与木叶警务部队本部补刀幸存者。虽然宇智波家族灭门，但这样一来木叶避免了内战，使村子守住了和平。

由于宇智波一族的灭门事件，团藏被禁足并解除一切权力。日斩意识到，警务部队不能拘泥于一族之人，应该广泛招收人才，为了村子的将来，必须适材适所才行，随后建立新的警务部队，日斩将团藏的根部成员与他的暗部成员用于控制新警务部队。

猿飞日斩

中忍考试

十二年后，在第三场中忍正式考试中，日斩特意邀请了盟友风之国砂隐村的第四代风影一同观赏这场这场淘汰赛，并设席于其旁。期间由并足雷同担任日斩的护卫，由于宇智波佐助未赶来参加考试，日斩多次推迟考试时间后佐助仍未来参加，随后日斩决定取消其资格，但因“第四代风影”的劝阻，日斩打消了此念头。

中忍考试

然而日斩却没发现，此时的第四代风影只是大蛇丸变化所为....

木叶崩溃

大蛇丸瞄准我爱罗进入暴走状态时，利用音隐及砂隐村向木叶隐村发动攻击。“风影”和他的部下把第三代火影捉到桔梗城楼之上，风影亦露出他的真面目，原来就是自己的学生——大蛇丸。大蛇丸的部下“音忍四人众”更在城楼上结出“四紫炎阵”，把大蛇丸及第三代火影围起来，作为他们战斗的地方，而结界所生之火焰令木叶暗部无法进入。第三代知道要逃出此阵不是一件容易的事。大蛇丸在对战前曾一度流下泪来，第三代认为杀害老师的他还是会伤心，大蛇丸则声称只是打呵欠才流泪，令在场的卡卡西、阿凯和暗部傻眼，随后向第三代火影发出挑战（有别于其手下药师兜在第二场中忍考试向第七班强调出其不意的偷袭才是忍者的作法）。