在处斩了两千多叛乱的水西土司兵俘虏后，既有摄于明军残酷血腥的，也有暗下决心选择继续与明军对抗的。
而其中被震慑住的多是土司府的高层与没有家人参与叛乱的人员，至于暗下决心继续与明军对抗到底的，多是那些被斩杀的至亲家人。
尽管奢社辉母子向洪承畴投降了，但洪承畴可不放心继续将他们留在水西城，而是将他们带回了贵阳府城，同时还留下了参将秦邦翰带着一个营驻守在了水西城，以防水西土司的再次叛乱与支援陈策在水西的战事。
回到贵阳府后，洪承畴开始给朝廷上请求在贵州施行改土归流的题本，计划废除水西、水东的世袭宣慰司与其它地区的宣抚司，改任通过科举产生的流官来接任这些府州县。
他将改土归流的内容主要分成七大内容：第一，废除宣抚司与宣慰司，设置府州县三级地方行政机构，并由朝廷派遣流官充任官职；
第二，将贵州布政司分成七府六十县，七府分别是贵阳府、都匀府、毕节府、安顺府、永宁府、镇远、铜仁；
第三，从其它布政司移汉民垦荒，充实地方，移易倮习；
第四，清查户口，丈量土地，统一赋税；
第五，建城池，设关卡，屯兵戍边；
第六，兴儒学，设置官学、乡学、义学，科举适当优惠，禁止苗民诸多宗教祭祀活动及风俗习惯，推行三纲五常及忠孝节义观念；
第七，计擒为上策，兵剿为下策，令其投献为上策，敕令投献为下策，治苗之法，当恩威并施。
在七条内容的后面，洪承畴还分别附上了八府六十县的具体名字与划分依据，比如，陆广与鸭池河以东区域并入贵阳府，同时并入贵阳府的还有龙里卫与威清卫。
至于原陆广河、鸭池河以西的水西宣慰司，与毕节卫、赤水卫合并，成立毕节府，府城毕节县，而原属于谷龙河以南的水西宣慰司地盘则划入安顺府。
此外，永宁州与普安州合并，成立永宁府，府城永宁州，平坝、安顺与镇宁三地合并后，成立安顺府，府城安顺州。
原新添卫、兴隆卫与平越府并入都匀府，府城都匀县，黎平府、思州府与苗疆腹地并入镇远府，府城镇远县，石阡府、思南府并入铜仁府，府城铜仁县。
洪承畴的题本在经过大半月的传递后，终于被送到了朱由校的案头上，简单看完内阁的票拟后，朱由校让刘时敏拿来贵州的地图，开始思考与比划洪承畴的府州县划分，在花了近两个小时的思考后，朱由校基本同意了洪承畴划分，并且还将遵义府也纳入了贵州布政司。
之所以将遵义府也纳入贵州，一个是后世的习惯使然，另一个则是贵州布政司实在太小，而他北面的四川布政司又过于庞大。
至于移汉民充塞贵州，朱由校自然是举双手赞成，他着令陕西布政司两年内从延安府迁出十万户进入贵州毕节、安顺、永宁、都匀等府。
对于这些充塞的屯民，朱由校不仅给予了土地、种子与租借耕牛的优惠，还允许免除赋税五年。
除此之外，朱由校还鼓励贵州布政司利用贫瘠的山地广种油桐，从而赚取种地外的额外收入，至于收获的桐油，自然会有四海商行下属的两家造船厂大量收购。
桐油是一种非常不错的防腐防潮的涂料，对于还是处于木质船只的时代，更是显得尤其的珍贵。
之前四海商行造船厂的船只涂料，多是来自武昌府的桐油，武昌府南靠太平山与幕阜山，那里本就有不少的野生油桐树。
在武昌造船厂需求大量桐油的时候，选择了与这里的山民合作种植油桐树，山民种植与采摘油桐，再拿到附近的油坊榨成油，之后再送到四海造船厂指定的收购点进行售卖。
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